Bakugan: Rise of the Resistance - это 2D-игра с высоты птичьего полета, основанная на мультсериале «Бакуган». Новая Вестория подвергается вторжению со стороны Хурранской Империи Измерений. Они обнаружили Священную сферу, содержащую всю ДНК бакуганов, украли из нее часть ДНК и использовали ее для создания репликаторов бакуганов. Игрок получает помощь от хурранского андроида по имени Ева-Q8, чтобы противостоять этому вторжению.
В игре игроку предстоит исследовать Новую Весторию и избавить ее от сил Хурранской Пространственной Империи. Игрок может свободно ходить по карте, пока не встретит врага. Затем игра перейдет в боевой режим защиты башни, в котором игрок управляет своим Бакуганом. Бакуган используется для размещения статических бакуганов (башен) на карте, а также для сбора ДНК для строительства новых башен. Бакуган также может атаковать врагов напрямую.