Версия Bolt для DS отличается от основной консоли и версии для ПК. Это также 3D-игра в жанре экшн, и, как и другая версия, она не рассказывает о событиях фильма, а вместо этого фокусируется на вымышленном телесериале, действие которого происходит в фильме. Игроку необходимо выполнять различные миссии шоу, управляя Болтом (которому уделяется основное внимание) и/или Пенни. В сериале рассказывается о злом персонаже мистере Калико, который похитил отца Пенни и пытается уничтожить Землю с помощью ракет. Игра ведется на нижнем экране, а на верхнем экране отображается название текущих миссий, прошедшее время и прогресс миссии. Игра ведется в 3D, но, как правило, всегда существует линейное движение вправо, а персонажи могут перемещаться в любом направлении во время боев. У персонажей есть полоска здоровья и отдельная полоска способностей. В версии DS используется экранный текст и нет озвучки, в отличие от другой версии.
Для атаки Болт использует атаки и различные сверхспособности, такие как звуковой лай. У Пенни есть колесо, с помощью которого можно сражаться, а также она может использовать его, чтобы проезжать по краям и взбираться на здания. Победив противников, можно собрать биты энергии. Они используются для повышения уровня и доступа к улучшенным способностям и новым комбо, расходуя их в трех областях: урон, броня и расход энергии (Болт) / скорость колеса (Пенни). Персонажи атакуют и прыгают с помощью кнопок, а сенсорный экран используется для специальных атак, уникальных для каждого персонажа. Другие способности Болта, такие как лазерное зрение и суперсила, используются только для решения мелких головоломок, связанных с окружающей средой. При использовании лазерного зрения объекты можно пронзить в определенных местах, прорисовав контур на сенсорном экране. Есть также разделы платформера, но игра не позволяет персонажам падать с уступов, а прыжки можно выполнять только при правильном построении. Время от времени необходимо победить босса, и, при желании, врагов можно пропустить, чтобы пройти уровни.
Игра поддерживает мультиплеер на основе двух копий игры. Одна из них - хакерская мини-игра, также присутствующая в однопользовательской части. Используя сенсорный экран, игроки используют стилус для составления рисунков, соединяя числа и фигуры, которые появляются на верхнем экране, чтобы построить счетчик с ограничением по времени. В многопользовательской игре два игрока могут мешать игре друг друга, используя бонусы. Второй многопользовательский режим - это дополнительная игра с помощником Рино. Это игра-лабиринт, похожая на Super Monkey Ball. D-pad или сенсорный экран используются для наклона уровня и катания Rhino по лабиринтам, избегая пяти типов препятствий, и здесь также невозможно упасть со сцены.
В игру входит инструмент для чата DGamer. После регистрации на веб-сайте игроки могут использовать соединение Wi-Fi для входа в систему и входа в различные чаты, связанные с Диснеем, для общения с другими игроками. Он включает в себя систему профилей с аватаром, который можно настроить. Дополнительные функции открываются постепенно по мере прохождения игры.