Наш герой - молодой монстр-скаут, отчаянно желающий принять участие в чемпионате, - надеется побороться в Monster Scout Challenge за честь стать чемпионом мира. Итак, герой скрывается на дирижабле «Альбатрос», направляющемся на Арену монстров. К сожалению, у судьбы на корабль другие планы. Из-за ужасного шторма он сбился с курса и разбился на неизвестном острове. Остров - опасное место, полное экзотических, невиданных ранее монстров, готовых к разведке. Но что еще более важно, пассажиры «Альбатроса» разбросаны по всему острову - нашему герою ничего не остается, как взять на себя ответственность, выследить их и найти способ сбежать с загадочного острова.
Dragon Quest Monsters: Joker 2 - это ролевая игра по вербовке монстров, очень похожая на свою предшественницу. Наш герой встречает монстров на поле и вовлекает их в пошаговые сражения со своими монстрами, чтобы либо победить, либо завербовать их. Он может изменять способности каждого монстра из различных деревьев навыков и комбинировать их, чтобы создавать новых монстров со своими собственными способностями.
Игрок также может вести свою команду в бой с другими игроками, локально или онлайн, и разведывать монстров, используя режим тегов, у других игроков в этой игре, а также в Dragon Quest IX и VI.