Frogger: Helmet Chaos - платформер с видом сверху, главным героем которого является аркадная лягушка восьмидесятых, но теперь в 3D. Основной игровой процесс по-прежнему остается игрой, поскольку лягушка перемещается на один (невидимый) квадрат за нажатие клавиши, что сохраняет ощущение оригинальной аркадной игры вместо современной, более плавной механики движения.
Когда Фроггер взбирается на дерево, чтобы принести немного лунных фруктов для Тоади, его друга уже нет, когда он возвращается. Он идет по своим следам и узнает, что Тоади находится под контролем доктора Вани, который приказал своим мини-крокодилам надеть шлемы контроля разума на всех жителей земли. Фроггер должен исправить это.
Игра состоит из разных небольших уровней с элементами головоломки. Фроггера можно перемещать на одну клетку за движение или на две за обычный прыжок. Эта механика чаще всего используется для навигации по платформам-лабиринтам с водой. По иронии судьбы, Фроггер тонет, прикасаясь к жидкости. Передвигаясь, он может собирать монеты, а для сохранения прогресса есть контрольно-пропускные пункты. Он может использовать свой язык, чтобы толкать или тянуть предметы, а также качаться на ветках. Также есть вертикальный прыжок, позволяющий добраться до объектов в воздухе, и он может повернуться на 90 градусов, чтобы посмотреть в другом направлении. У лягушки ограниченное количество жизней, но одну можно восстановить, подобрав яблоко.
История продолжается посредством нарисованных кат-сцен со статичными изображениями и закадровым голосом (на PSP есть только письменный текст для версии DS). Версия для PSP поддерживает совместное использование игр, а на верхнем экране DS отображается статистика игры в сюжетном режиме. Также есть семь мини-игр, в том числе оригинальная аркада Frogger, но с отточенной графикой, а также шляпы и костюмы, которые можно разблокировать за собранные монеты.