Сюжет Kingdom Hearts: Birth by Sleep состоит из 3 сценариях, каждый из которых фокусируется на усилиях одного из трёх главных героев найти Мастера Xehanort. В некоторых моментах пути главных героев будут пересекаться, но большую часть времени каждый из них путешествовать в одиночку. Главные герои это Ventus, Terra и Aqua, которые имеют свой собственный боевой стиль.
Ventus: исвестен ,как "Ven" ,его сильнейший аспект это скорость,носит keyblade. Terra: специализируется на силе, также носит keyblade.Он лидер группы и является братом Ventus. Его личность довольно крута и его можно описать, как сильного и тихого человека. Aquа: Единственная женщина в команде,специализируется на магии,также как все остальные носит keyblade. Самая серьёзная в команде, но волнуется о друзьях, когда они в беде.