Игроки управляют персонажем по имени Линк, сражающимся с монстрами в 11 огромных подземельях, находящихся в двух диаметрально противоположных мирах. После того, как злобный колдун Agahnim убил доброго короля Hyrule и захватил принцессу Зельда, Линк должен обязательно спасти принцессу и восстановить мир и спокойствие на Земле. В игре есть уникальный многопользовательский режим, называющийся Четыре Меча (Four Swords), где до 4-х игроков могут каждый сражаться за "клона" Линка в одеждах разных цветов. При этом игроки должны работать как единая команда, уничтожая многочисленных монстров, собирая деньги и упавшие у врагов предметы. Причём эти предметы можно передавать при необходимости другим членам отряда, поскольку кооперативные действия это ключ к решению многочисленных головоломок и помогают обеспечить победу в схватках с боссами.